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Centros de Salud
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Departamento de Adquisiciones
Departamento de Auditorías
Departamento de Capacitación y Desarrollo
Departamento de Contabilidad
Departamento de Control Presupuestal
Departamento de Diseño y Creatividad
Departamento de Enfermería
Departamento de Enseñanza
Departamento de Epidemiología
Departamento de Estadística
Departamento de Estudios y Proyectos
Departamento de Evaluación Integral
Departamento de Fortalecimiento a la Descentralización
Departamento de Fortalecimiento de la Asistencia Médica y Coordinación de Hospitales de Primer Contacto
Departamento de Hospitales Metropolitanos e Institutos
Departamento de Información
Departamento de Informática Administrativa
Departamento de Informática en Salud
Departamento de Investigación
Departamento de Legislación, Dictaminación y Convenios
Departamento de lo Contencioso
Departamento de Medicina Preventiva
Departamento de Municipios por la Salud
Departamento de Normatividad en Servicios de Salud
Departamento de Obras, Conservación y Mantenimiento
Departamento de Operación
Departamento de Organización y Métodos
Departamento de Pagos
Departamento de Primer Nivel de Atención
Departamento de Programación y Presupuesto
Departamento de Promoción de la Salud
Departamento de Quejas, Denuncias y Responsabilidades
Departamento de Relaciones Laborales
Departamento de Salud Reproductiva
Departamento de Segundo Nivel de Atención Médica
Departamento de Servicios Generales
Departamento de Sistematización de Pagos
Departamento de Vectores y Zoonosis
Direcciones
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Dirección de Contraloría Interna
Dirección de Desarrollo Institucional
Dirección de Descentralización y Proyectos Estratégicos
Dirección de Difusión y Diseño
Dirección de Informática
Dirección de Participación Social
Dirección de Prevención y Control de Enfermedades
Dirección de Programación y Evaluación
Dirección de Recursos Financieros
Dirección de Recursos Humanos
Dirección de Recursos Materiales
Dirección de Regulación de la Atención Médica
Dirección de Supervisión y Asesoría
Dirección General de Administración
Dirección General de Planeación
Dirección General de Regiones Sanitarias y Hospitales
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Hospitales