Centros
Centro de Atención Integral en Salud Mental “CAISAME” Estancia Breve
Centro de Atención Integral en Salud Mental “CAISAME” Estancia Prolongada
Centros de Salud
Departamento de Abastecimiento (Almacén Central)
Departamento de Administración de Tecnologías
Departamento de Adquisiciones
Departamento de Auditorías
Departamento de Capacitación y Desarrollo
Departamento de Contabilidad
Departamento de Control Presupuestal
Departamento de Diseño y Creatividad
Departamento de Enfermería
Departamento de Enseñanza
Departamento de Epidemiología
Departamento de Estadística
Departamento de Estudios y Proyectos
Departamento de Evaluación Integral
Departamento de Fortalecimiento a la Descentralización
Departamento de Fortalecimiento de la Asistencia Médica y Coordinación de Hospitales de Primer Contacto
Departamento de Hospitales Metropolitanos e Institutos
Departamento de Información
Departamento de Informática Administrativa
Departamento de Informática en Salud
Departamento de Investigación
Departamento de Legislación, Dictaminación y Convenios
Departamento de lo Contencioso
Departamento de Medicina Preventiva
Departamento de Municipios por la Salud
Departamento de Normatividad en Servicios de Salud
Departamento de Obras, Conservación y Mantenimiento
Departamento de Operación
Departamento de Organización y Métodos
Departamento de Pagos
Departamento de Primer Nivel de Atención
Departamento de Programación y Presupuesto
Departamento de Promoción de la Salud
Departamento de Quejas, Denuncias y Responsabilidades
Departamento de Relaciones Laborales
Departamento de Salud Reproductiva
Departamento de Segundo Nivel de Atención Médica
Departamento de Servicios Generales
Departamento de Sistematización de Pagos
Departamento de Vectores y Zoonosis
Dirección de Asuntos Jurídicos
Dirección de Contraloría Interna
Dirección de Desarrollo Institucional
Dirección de Descentralización y Proyectos Estratégicos
Dirección de Difusión y Diseño
Dirección de Informática
Dirección de Participación Social
Dirección de Prevención y Control de Enfermedades
Dirección de Programación y Evaluación
Dirección de Recursos Financieros
Dirección de Recursos Humanos
Dirección de Recursos Materiales
Dirección de Regulación de la Atención Médica
Dirección de Supervisión y Asesoría
Dirección General de Administración
Dirección General de Regiones Sanitarias y Hospitales
Dirección General de Regulación Sanitaria
Dirección General de Salud Pública
Dirección General del Régimen Estatal de Protección Social en Salud (Seguro Popular)
Hospitales
Hospital Comunitario de Atotonilco el Alto
Hospital Comunitario de Cihuatlán
Hospital Comunitario de Colotlán
Hospital Comunitario de El Grullo
Hospital Comunitario de Encarnación de Diaz
Hospital Comunitario de Huejuquilla el Alto
Hospital Comunitario de la Huerta
Hospital Comunitario de Ojuelos
Hospital Comunitario de San Juan de los Lagos
Hospital Comunitario de Sayula
Hospital Comunitario de Tala
Hospital Comunitario de Tamazula
Hospital Comunitario de Teocaltiche
Hospital Comunitario de Tomatlán
Hospital Comuntario de Mascota
Hospital General de Occidente
Hospital Materno Infantil
Hospital Regional de Ameca
Hospital Regional de Autlán
Hospital Regional de Ciudad Guzmán
Hospital Regional de Cocula
Hospital Regional de La Barca
Hospital Regional de Lagos de Moreno
Hospital Regional de Magdalena
Hospital Regional de Puerto Vallarta
Hospital Regional de Tepatitlán
Hospital Regional de Yahualica
Institutos
Instituto de Cirugía Reconstructiva
Instituto de Dermatológico de Jalisco
Instituto de Jalisciense de Alivio del Dolor y Cuidados Paliativos
Instituto de Salud Mental
Región Sanitaria I Norte - Colotlán
Región Sanitaria II Altos Norte – Lagos de Moreno
Región Sanitaria III Altos Sur - Tepatitlán
Región Sanitaria IV Ciénega – La Barca
Región Sanitaria IX Valles - Ameca
Región Sanitaria V Sureste - Tamazula
Región Sanitaria VI Sur – Ciudad Guzmán
Región Sanitaria VII Costa Sur – Autlán de Navarro
Región Sanitaria VIII Costa Norte – Puerto Vallarta
Región Sanitaria X Hidalgo - Zapopan
Región Sanitaria XI Libertad - Tonalá
Región Sanitaria XII Reforma - Tlaquepaque
Región Sanitaria XIII Juárez - Tlajomulco
Unidad Especializada de Atención Obstétrica y Neonatal