Departamento de Abastecimiento (Almacén Central)
Hospitales
Hospital Comunitario de Atotonilco el Alto
Hospital Comunitario de Cihuatlán
Hospital Comunitario de Colotlán
Hospital Comunitario de El Grullo
Hospital Comunitario de Encarnación de Diaz
Hospital Comunitario de Huejuquilla el Alto
Hospital Comunitario de la Huerta
Hospital Comunitario de Ojuelos
Hospital Comunitario de San Juan de los Lagos
Hospital Comunitario de Sayula
Hospital Comunitario de Tala
Hospital Comunitario de Tamazula
Hospital Comunitario de Teocaltiche
Hospital Comunitario de Tomatlán
Hospital Comuntario de Mascota
Hospital General de Occidente
Hospital Materno Infantil
Hospital Regional de Ameca
Hospital Regional de Autlán
Hospital Regional de Ciudad Guzmán
Hospital Regional de Cocula
Hospital Regional de La Barca
Hospital Regional de Lagos de Moreno
Hospital Regional de Magdalena
Hospital Regional de Puerto Vallarta
Hospital Regional de Tepatitlán
Hospital Regional de Yahualica
Regiones
Región Sanitaria I Norte - Colotlán
Región Sanitaria II Altos Norte – Lagos de Moreno
Región Sanitaria III Altos Sur - Tepatitlán
Región Sanitaria IV Ciénega – La Barca
Región Sanitaria IX Valles - Ameca
Región Sanitaria V Sureste - Tamazula
Región Sanitaria VI Sur – Ciudad Guzmán
Región Sanitaria VII Costa Sur – Autlán de Navarro
Región Sanitaria VIII Costa Norte – Puerto Vallarta
Región Sanitaria X Hidalgo - Zapopan
Región Sanitaria XI Libertad - Tonalá
Región Sanitaria XII Reforma - Tlaquepaque
Región Sanitaria XIII Juárez - Tlajomulco
Unidad Especializada de Atención Obstétrica y Neonatal